Les Dresseurs des bases secrètes sont un type de Dresseur qui ne peut être affronté que dans les Super Bases Secrètes de Hoenn. Ils sont de classe différente, selon la classe que le joueur a choisi d'incarner. Les Dresseurs des bases secrètes peuvent être distingués en deux catégories : celui qui possède la base, et ceux qu'il a recruté. Ceux-ci apparaissent tous sous le nom de Sbire.
L'équipe du propriétaire de la base secrète est composée des trois premiers Pokémon que le joueur possède réellement. Ceux-ci sont mis à jour lors de la connexion au PSS. Les Sbires ont quant à eux des Pokémon préalablement définis par le jeu, et qui ne peuvent être modifiés.
Le niveau des Pokémon du propriétaire de la Base Secrète est défini par le nombre de Badges que possède le joueur avec la formule suivante :
- (nombre de Badges + 2) * 5
Ainsi, le niveau maximum est 50. Cependant, ce niveau peut être débloqué si le Débloque Niveau est installé dans la base et s'il est activé.
En effet, celui-ci permet d'affronter des Pokémon de niveau 100 au maximum. Si le Pokémon a un niveau inférieur à 100, c'est le vrai niveau de la partie du joueur qui s'affiche.
Le débloque niveau est donné par une Combattante à l'Atoll de Combat.
Le niveau des Pokémon des Sbires est basé sur le niveau de ceux du propriétaire de la base et il suit une autre formule :
Le niveau maximum est donc 95.
Les gains suite à une victoire sont aussi définis. Ils suivent la formule suivante :
- niveau du dernier Pokémon affronté * 20

Le montant maximum est donc de 2000
.
Les duels sont par défaut des batailles à un contre un, mais les règles peuvent être changés grâce à l'objet de décoration Panneau Règles.
Les règles possibles sont : Solo, Duo, Trio, Inversé, et Rotatif.
Tous les Pokémon affrontés dans les Bases Secrètes seront marqués comme vus dans le Pokédex.
Les Pokémon sont automatiquement soignés après chaque combat.
Liste des Dresseurs et de leurs Pokémon[modifier]