Grande nouveauté de la version Émeraude, la Zone de Combat, remplaçante de la traditionelle Tour de Combat, est située sur une île au sud-est de la région de Hoenn, à proximité du chenal 130. C'est un lieu où les dresseurs d'exception se retrouvent et s'affrontent selon des règles strictes, variant d'un bâtiment à un autre. Ceux qui enchaînent les victoires ont par ailleurs la possibilité de défier en personne l'un des meneurs de la Zone.
La Zone de Combat n'est accessible qu'au dresseur ayant triomphé de la Ligue de Hoenn, en embarquant au bord du ferry "Marina", en partance de Nénucrique ou de Poivressel.
