Modification de Darkrai

Darkrai est là aussi le principal antagoniste. Il veut créer un monde parfait dans le [[Parc des Vœux]] mais son projet finit par menacer l'existence même des deux mondes. Au final, il se sacrifie dans le tourbillon de noirceur qui était censé détruire le Poképark et le Parc des Vœux avec le Lumipolariton en main. Pikachu, Moustillon, Vipélierre et Gruikui se lancent dans une quête pour sauver Darkrai en devenant ami avec [[Reshiram]] et [[Zekrom]] qui le sauve du fond du tourbillon de noirceur, est finit par devenir ami avec le groupe. Le joueur le rencontre pour la première fois dans la Zone Fureur du Parc des Vœux. Il bat facilement [[Trioxhydre]] et [[Tranchodon]] avec [[Vibrobscur]] et Trou Noir. Le joueur le combat en tant que Boss final de l'histoire principale. Il peut se téléporter, et charger le joueur avec une aura sombre. Une autre de ses attaques consiste à donner un coup de poing chargé d'ombre. Lorsqu'il n'a plus que la moitié de ses PV, il lance des balles d'ombre qui immobilisent le joueur dans une sphère noire translucide pendant une très courte durée. Une fois battu, il devient gigantesque et lance des attaques très puissantes. Il peut lancer quatre boules noires explosives avant de jeter la sienne. Il peut lancer trois ondes de choc ou écraser ses mains sur le sol, créant une explosion ténébreuse. Il peut également lancer un laser noir énorme.